Jens Plücker studierte Bei Prof. Erich Penzel in Köln. Er begann bei den Bochumer Sinfonikern als Solohornist seine Orchesterkarriere. 1996 wurde er in gleicher Position Hornist des Philharmonischen Staatsorchesters Hamburg und wechselte 2002 zum NDR Elbphilharmonie Orchester. Neben seiner Orchestertätigkeit (u. a. auch als Aushilfe bei den Berliner Philharmonikern, dem Symphonieorchester des BR oder dem SWR Sinfonieorchester Stuttgart) trat Jens Plücker als Solist z. B. mit dem NDR Elbphilharmonie Orchester, den Hamburger Philharmonikern, Tokio philharmonic orchestra, dem Mozarteum Orchester Salzburg, der Philharmonia Hungarica, den Bochumer Sinfonikern und verschiedenen Landesjugendorchestern auf. Bis 1999 war Plücker Mitglied im Delos-Holzbläserquintett, mit dem er im In- und Ausland konzertierte und zahlreiche CD- und Rundfunkaufnahmen für den BR, SWR, WDR und NDR einspielte. Das Ensemble gewann 1993 den 1. Preis beim Internationalen Kammermusikwettbewerb in Osaka/Japan sowie 1994 den 1. Preis beim Deutschen Musikwettbewerb. Seit der Gründung im Jahr 2004 ist Jens Plücker Mitglied bei NDR Brass.

Im Jahr 2000 wurde Jens Plücker der Eduard-Söring Preis der Stadt Hamburg verliehen. Seine Konzert- und Kammermusikauftritte ergänzt er durch Lehrtätigkeiten etwa bei verschiedenen Meisterkursen weltweit. Seit 2012 ist er CEO der Akademie des NDR Elbphilharmonie Orchesters e.V.